成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。中国青年范宗杰对武术有狂热的爱好，为了达到武术的更高境界，来到韩国找拳界老前辈申荣正比武。在一次抓小偷事件中，因故结识了女子跆拳道会馆的教练南宫，并与之结为好友。范找到申老前辈办的武馆，才得知申已退休，而武馆则改成袁氏武馆，碰巧遇上馆主挑战另一个馆主白木，袁被白木打败，范佩服白的身手，并拜师学艺。白见范是可造之才，收之为徒，学有成就，白带范找申切磋比武，但范所爱慕的女学员即申的女儿申明美。在比武中，范打伤申而自责不已，更想不到的是，明美是南宫的女学员，也是南宫爱慕之人。袁氏武馆使计让范与南宫因明美互相残杀，使白木孤掌难鸣而围攻，将其打残，范与南宫忍无可忍，与袁氏展开一场生死之战……在不远的将来，近10年的核战争几乎摧毁了整个地球，人类正经历着即将灭绝的灾难。此时，地球处于无序与暴力盛行的可怕状态。在一座小镇的饭店里，两个黑帮分子正在向饭店店主索要保护费。而充满争议的高手托尼打抱不平，将两个黑帮分子赶走。店主被托尼的见义勇为所感动，将他介绍给了小镇的神父李。神父仰慕托尼的身手与人品，为他介绍了小镇的情形。原来小镇被两个黑帮团伙把控，一个叫飞蛇，一个叫暴龙。这两个团伙强取豪夺，小镇的居民敢怒不敢言。托尼决心铲除这两个团伙，他应征去飞蛇作了保镖。托尼不但打击了飞蛇内部的骨干，而且挑起了两个团伙的矛盾。最终，两个团伙逐个覆灭。而贪婪的神父李却在托尼的背后放了冷枪，托尼杀掉了神父，小镇终于迎来了片刻的平静。描述一个骑兵队的斥候与印第安酋长之间的敌意因一场格斗而化解，双方并签下和约。小城突然发生一场命案,青年邵兵饰演的刑警负责调查。经过仔细排查,走访,事件真相渐渐露出水面,刑警(邵兵)却突然坠楼。作为潜水教练的卡梅伦一直拥有着她喜爱的生活以及在迈阿密港口做管理工作的英俊未婚夫。当他们即将步入婚礼教堂的时候，她的未婚夫成为了一起谋杀案的主要嫌疑人，事件的种种证据都指向她的未婚夫，这一刻她的整个世界都面临崩塌。卡梅伦始终不相信未婚夫是杀人犯，在卡梅伦查找真相的同时，一位记者进入了她的视线，表面上在帮助她的未婚夫洗脱嫌疑，可是事情并没有那么简单，一起惊天阴谋即将浮出水面。