曾经是国家秘密组织要员的姜起泰，因为政治阴谋被逐出了组织，于是展开一系列活动向国家进行报复。在市长视察地铁活动的这天，姜起泰及其同伙在横穿城市中心的7103次地铁上装上炸药，并控制了地铁以此要求见前总理宋日权。由于在限定时间内宋日权没有到达，姜起泰杀死了市长。张警官曾是一名出色的干探，但在一次保护政要的行动中，他不仅失去了至爱，更发现上司是一个贪污集团的主脑人物。自此以后，他选择了在地铁警区工作。在这次地铁袭击案件中，姜起泰与张警官相遇了，两人展开了一场殊死搏斗，最终张警官为了挽救乘客，最后光荣殉职。15年前，安德烈在他的父亲罗迪纳上校的安排下，在一所秘密培养情报局特工的特殊学校接受培训，从十几岁开始接受训练。多年后因故训练计划被迫中止，安德烈选择留在欧洲，并试图忘掉不堪的过去。某天，众人以为已经过世的父亲突然来电，告知安德烈有不知名人士正通缉他。安德烈只好跑去找初恋情人、同时也同在学校受过训练的玛莎，一起寻找真相，竟逐步发现了不为人知的大规模间谍活动…庄严的皇宫内，十二位以属相命名的大内密探肩负着贴身保护皇上的重任，其中高天九外号“灵灵狗”（古天乐饰）是一位满脑子充满奇想秒招的发明家。他靠各种“法宝”在保护皇上的过程中屡建奇功，但对于自己风情万种却功艺高强的未婚妻梅希望（大S饰）的一片痴心，“灵灵狗”的反应却表现的相当木讷。为了让这“灵灵狗”这个木瓜开窍，梅希望想出了一个试探“灵灵狗”的办法。深宫之类忠奸难辨，暗藏杀机。围绕公主选附马一事，各方面的力量都暗自勾结，企图谋权篡位并消灭以“灵灵狗”为首的大内密探，皇上安危遭受威胁，十二密探面临前所未有的挑战。1947年夏末，我国人民解放军第一野战军的某军医院随军转移的途中，走到一望无际的沙漠上。一小股流窜的敌人骑兵尾随追来。伤病员们都需要水，但是水壶里一滴水也没有了，干渴疲劳威胁着这支队伍，缺水成为此时至关重要的问题。刘医生、指导员和伤病员们，紧紧地依靠当地群众，当地群众也积极的支持人民解放军。在一位回民老汉的热情帮助下，部队解决了缺水的问题。而在急救药品极度缺乏的情况下，回民老汉又一次伸出援助之手，将仅有的给孙子治病的哉木哉美水献了出来。就在这时，后面尾随而来的敌人追了上来，老汉慌忙之中将哉木哉美水的牛角丢到了河滩里。伤员孙吉甫同志当时冒着生命危险去河滩里找牛角，结果，在途中负伤被敌人俘虏。刘医生用尽全力治好了回民老汉的孙子的疾病，此时后面尾随追来的敌人已经赶到了他们驻扎的地方。刘医生隐蔽在回民老汉的家里。回民老汉给追上来的匪徒喝了放有麻醉药的水，匪徒们被麻醉纷纷地倒下了。刘医生等人缴获了匪陡的枪支弹药，救出了为找牛角而受伤被俘的伤员孙吉甫。军队和人民紧密联合，克服了重重困难，使武装的匪陡不但没能消灭我军赤手空拳的医务人员和伤病员，反而成了俘虏，最终我军成功的完成了转移任务。伦敦的夜晚最近很不平静，有三位女子在深夜被杀害，她们的手指也被切去了，这引起了很大的轰动。在警察加紧追查的时候，竟然又有女子被杀，情况相同。又到了福尔摩斯出场的时刻了，这时有位富商之女去见福尔摩斯，她发现她的父亲是嫌疑人，正当福尔摩斯赶去她家的时候，却意外地发现她父亲已经死了。种种证据显示此案是已经死的摩日阿提所为，将别人催眠再利用他们杀人。这时，福尔摩斯遇到了一位穿着绿色衣服的神秘女子。他觉得她与此案有关。在经过调查之后，福尔摩斯深入敌穴，然而这次福尔摩斯是否能够化险为夷呢？前人类和普通人类的人种战争已经到了白热化的阶段，野野村组长去世后，吉川（北村一辉饰）、当麻纱绫（户田惠梨香饰）和濑文焚流（加濑亮饰）等人聚在未详总部，苦苦思索J教授的真身。谁知就在当麻刚刚弄清真相的同时，警察医院内的成年和儿童SPEC持有者遭到残忍屠戮。愤怒的当麻无法抑制体内被封印的SPEC，她狂乱暴走，继而现身御前会议。在犹大、世界（向井理饰）、润（大岛优子饰）的见证下，法蒂玛第三预言实现了。恐怖刺眼的蘑菇云在上空升起，成千上万的八尺乌遮天蔽日，被欲望所支配与荼毒的世界迎来了毁灭时刻。　　在命运的交叉点，当麻和焚流能否阻止世界的灭亡？