在前三集里，动画片描述了麦兜灰色的成长故事，让观众在欢笑中感受到一丝淡淡的忧伤。这一次，在《麦兜·武当》中，麦兜的故事依然从灰色的幸福开始。暑假，当小朋友都到新西兰滑雪、到北京大学学普通话、到剑桥学英文并顺道看看哈利·波特的时候，家境贫寒的麦兜因为妈妈北上武汉做食肆生意，只好被“暂寄”在武当山的武术学校“太乙春花门”学习太极拳。孤独的人类小男孩想要一个弟弟，一次机缘巧合，小男孩读到了鹳鸟送子的故事，于是他给鹳鸟公司写了一封许愿信。但是这时的鹳鸟公司已经顺应时代潮流改革成了快递公司，不再运送婴儿。鹳鸟山上唯一的人类女孩小郁无意中开启了婴儿制造机制造出了萌娃，最优秀的鹳鸟快递员朱尼尔正处于升职加薪的关键时期，被意外制造出的萌宝就像一个难题悬在他的头顶，于是他和小郁组成了“送宝特工队”，想要在老板发现之前送走这个小麻烦。林大川是刚刚从警校毕业的年轻警察，这次雨夜抓捕走私团伙的行动是他第一次出来执行任务。但是由于林大川经验不足，面对歹徒时紧张犹豫没有开枪打中犯罪分子，导致歹徒逃脱，同他一起执行任务的老宋警察也伤重住院。县公安局的刘福局长根据林大川的实际情况，想把他调到基层去锻炼一下。林大川毫不犹豫的就同意了。林大川被调到了古窑镇派出所。这是只有一个老警察的派出所。老警察罗建国在这座小镇上生活了几十年。老罗带着新来的林大川熟悉小镇的环境，林大川就在派出所的宿舍里安顿了下来。夜晚，林大川总是被雨夜的噩梦惊醒，那次的雨夜行动一直是他心中解不开的结。这个小镇平时没什么案子，挺多是有小偷扒窃或是哪家农户的牛走丢了。林大川始终觉得这样的案子没什么意思。一次，老罗和林大川在街边吃饭，看到有小偷行窃，林大川却没有抓住小偷。但是没想到小偷六子竟会主动找老罗投案自首。原来六子的爹病重，家里没钱治病，六子迫不得已才这么做。老罗让六子交出钱包并放了他。林大川对此不解，觉得应该将六子拘留。老罗告诉他不应该死记书本上的规范，特殊问题应该特殊对待。刘征是这家小镇上一家酒厂的总经理，是优秀的农民企业家。他的女朋友罗晓燕是警察老罗的女儿。老罗一直反对女儿和刘征谈恋爱并且同居。父女二人因此不相往来。林大川的女朋友杨晶晶从城里开车来看他并劝他可以通过爸爸的关系调回去。但是林大川始终放不下心里的心结所以不肯回去。六子的父亲要换肾，医院说需要二十多万。六子为此事一直发愁。刘征的白酒厂搞抽奖活动，六子抱着侥幸心理去抽奖却中了大奖。但是工作人员告诉他是以实物形式兑现价值三万元的白酒，六子要现金被哄了出来。罗晓燕与刘征吵架后在家上网，网名为睡不着的燕子。林大川平时也经常上网化名为英雄。二人在网络上经常聊天，成为好朋友。正好两人心情都不好，二人约好周末见面。六子去偷刘征放在车后备箱的箱子，正好偷听到了他和刘副局长的谈话。原来刘征和孟广生都是走私团伙的犯罪分子，而刘征就是雨夜行凶逃脱的歹徒。孟广生走漏了风声，刘征想除掉他然后逃走。六子把偷回家的箱子打开没想到里面不是钱，而是一堆账单数据。刘征派黄毛等人抓六子，六子跑道派出所找到老罗和林大川将事情详细叙述。原来刘征不仅走私而且还造假酒。老罗让林大川去市里报案，他先去白酒厂找女儿。罗晓燕与刘征发生争执，刘征打了罗晓燕，老罗上前制止被刘征拿枪挟持。林大川带警察赶到。林大川去救老罗，老罗为了不让刘征逃跑受了重伤。林大川赶到为了救老罗情急之下终于开了枪，击中歹徒.......案子终于破了。圣诞节前夕，一个金发美女空降邮局，她的工作是为圣诞老人回信，实现人们的圣诞愿望。有一个小女孩在信中说，希望帮她孤独的叔叔找一个女朋友，这位孤独的叔叔正是邮局的信件分拣员，由于工作接触，与神秘的圣诞女孩情投意合，小女孩也非常喜欢这位金发美女。可是平安夜却发生了误会，有情人能不能终成眷属呢？一个时空旅行者回到耶稣的年代，用摄像机拍下了耶稣的身影，2000多年后，一队考古学家在以色列发掘出了……小彤（林心如饰）是D吧里的狂野女鼓手，与女同事情同手足。为了帮女同事偿还高利贷，夜里不幸被街市小混混砍伤昏迷街头。达开（黄维德饰）在街上路过，偶遇受伤的小彤并送他回家包扎好便离去。一面之缘却令达开爱上了小彤。几日过后达开去酒吧遇到正与人争执的小净（林心如饰），并从中调解，遭到对方一阵拳脚。小净感激之余对达开也颇生好感，但达开却以为小净就是上次自己所救的那个女孩小彤。并向她表白，小净莫名其妙，但心底煞是喜悦，另一方面小蓝（吴辰君饰）和付振云（黄少祺饰）两个生命中相识的恋人几度相逢又别离的人生。作为知性、事业心重的上班族，戏里和初恋情人黄少祺有许多学生时期的美好回忆。影片中错综复杂的感情，三起三落的人生。让人即回味又深思……五人的关系就像现代男女，在黑夜与白天的错身当中，感情有了不同的邂逅与相遇……