一群青少年、一个野生动物公园、一个夏天组合在一起，以海龟的视角发生的一段故事。阿龙并没有真正的练过功夫，只是他父亲练时偷偷的学了一些，他靠着偷学的一招半式闯荡江湖，经常被别人欺负，他决心苦练，只有在苦练成武功后才不会受别人的欺负，于是他一个人进入深山中苦练，终于让他练成了一身好功夫。民国国立北平史料档案局被称为“红楼”，关于红楼，流传着许多恐怖的传说。一晚，一个名叫胡司仁的“冤魂”嘱托红楼值夜班的老余，希望他能去胡家峪让他的女儿胡妹找回自己的尸骨安葬。受到惊吓的老余让儿子望然（李威饰）去一探究竟，果然找到了胡妹（梅俪儿饰），两人便一起踏上了追查骸骨的路途。但过程中灵异事件不断：红楼出现的红衣女鬼、葡萄架上满布的头颅、红楼中又有厉鬼出现，更可怕的是卷入到事件中的人接连死亡。而灵异事件的源头、胡司仁的下落，种种线索都指向了红楼，众人潜入了红楼的禁区——地下室，却发现更可怕的惊天秘密……天才科学家李斯坦再次来到了古代，来到了1646年（顺治三年），此时正值大明灭亡满清入关，满清灭亡明朝之后，他们相遇只因前世的一次回眸结局却是穿越时空的一次牵手。梁峥本为香港警队中著名的警花，怎料目睹丈夫为救自己而被击毙，痛心之余，性情也变得怪异，后争被委派前往新加坡执行任务，期间，她结识了身手不凡的助手玲（李婉华），不过由于玲年过三十，开始为自己打算，故早已掉了拼搏之心。这对拍档来自不同背景与极端的心态下，调查军火线索，结果闹出笑话连篇。经过一番追查，终于在一小岛上得悉。城市在恢复平静后，大反派重新召集旧部卷土重来，并勾结外星恶势力朗格试图称霸地球，忍者神龟莱昂纳多（皮特·普劳泽克饰）、拉斐尔（阿伦·瑞奇森饰）、多纳泰罗（杰瑞米·霍华德饰）和米开朗基罗（诺尔·费舍饰）与女记者艾蓓丽尔·奥尼尔（梅根·福克斯饰）、韦恩·芬威克（威尔·阿奈特饰），及面具义警凯西·琼斯（斯蒂芬·阿梅尔饰）并肩作战打击恶徒。在史莱德逃脱拘留后，他与疯狂的科学家巴克斯特斯·托克曼（泰勒·派瑞饰）及其两个笨拙的左膀右臂猪面和牛头联合，发布了一个控制世界的恶魔计划。在神龟们与史莱德及其同伙对抗的同时，他们发现自己正面临着一个更邪恶的力量大反派格朗，神龟们面对的将是宇宙级的强大对手。