《深夜食堂2》延续该系列的治愈系风格，上演着美食诱惑和一个又一个普通但耐人寻味的故事。午夜12点“深夜食堂”开始营业，老板沉默可亲、厨艺精湛。这间充满人情味的小店成为大家觅食聚会、憩息畅谈的避风港。心情低落时就会穿“丧服”减压的赤冢范子接连遭遇了工作和感情双重打击；高木清太爱上比自己大十几岁的女人而与母亲发生冲突；老太太小川夕起子始终无法走出抛夫弃子的阴影，在第一部中受食堂老板恩惠的小满收留老太太却不被理解，警察小暮一如既往地维护着街区的平静……他们将如何解开心结，走出困境，“深夜食堂”在灯火阑珊中见证着一切。Samuel和BeckettEmerson兄弟在父亲的阴影下艰难度日。他们的父亲Warren，赌博、酗酒将兄弟俩带回家的所有钱花光。生活的困窘消磨着人的意志，每个家庭成员都以自己的方式寻找着心灵安慰，莎士比亚，连环画，以及镜花水月的爱情。Beckett希望通过伪造偿还父亲的一些欠款。但随着Beckett计划失败，为了生活，这个家必须做些改变……大学毕业前夕，“蚂蚁”们忙忙碌碌都在为自己的前途和理想奔忙着，大家各得其所，也最终明白了面对生活，要永远保持一颗真诚的平常心。短短几天内，三个没有任何关联的知名人士面带微笑意外死亡。与此同时，热血青年警察王不二与老油条黄飞红搭档破案，惹出不少的乱子，令他们的上司Angela郁闷不已。某天，地产项目经理王峰微笑死亡，案子交到Angela一组手中。为了尽快扭转警局中的不利局面，Angela、王不二和黄飞红展开全力追查，他们率先从与几名死者都有过交往的女演员刘金水入手。而在这一过程中，妖艳鬼魅的戴依依出现假如伪装隐藏有段位，憨豆先生融入墙壁，会伪装的霸王龙才是王者乾隆年间国泰民安，百姓安居乐业欣欣向荣过的是好不快活。\n皇上在御前侍卫高迪的陪同下前往江南体恤民情。在皇上出宫后一长阴谋正在展开，一位野心勃勃的王爷竟然暗地与当地黑帮勾结一路追杀皇帝。　\n在前往惠州城的路上遇上了从京城逃婚离家的野蛮格格贾仁。经过一场“恶斗”后三人决定一同上路，在惠州城的集市遇到了在集市中摆擂台的“洋鬼子”元宵。元宵在比试中输给了贾仁格格执意要让贾仁格格收他为徒。三人想尽办法却无法摆脱元宵，无奈只能收下元宵为徒。半夜在惠州城的某客栈，突然出现蒙面黑衣人刺杀皇帝，还好刺客技艺不精，皇帝没有受到半点伤害。高迪决定四人连夜赶往他的老家避难。