成为“第三次冲击”元凶的碇真嗣，变得像废人一样……真嗣还能振作起来吗？2012年《福音战士新剧场版：Q》之后，这部动画讲述了被封印的故事的后续。故事主要发生在一家专门为罪犯们服务的超豪华会员制医院，朱迪·福斯特在里面扮演外号为“护士”的角色，她医术高超，在这所拥有最为先进的医疗设备的医院中抢救过各种杀手匪徒的性命，甚至与世界上一些危险人物打过交道。某天传奇犯罪头目Niagara在街头与人交火，身负重伤被送往此处，而他的到来引来了一帮犯罪分子的暴力冲突，并且有一个“病人”还要彻查医院，“阿尔忒弥斯酒店”陷入危机。约什是一家牛仔风格牛排餐厅的服务员，一直以来他都有辞职就读法学院的打算，但都没能忍心向经理高飞递上辞呈。约什答应女朋友珍妮一定辞职的当晚，即将接手餐厅的德国老板派弗朗茨前来巡视。在高飞的再三要求下，约什只好硬着头皮熬过这“最后一晚”。没想到的是，意外状况接二连三发生——服务员短缺、态度嚣张的顾客、高飞醉酒导致短路……特派员弗朗茨一一记录他们的“恶行”准备上报，被群情激奋的服务员关在后厨。为此约什带领大家开始了一场“自卫反击战”。新来的实习生亚历克斯迅速和大家打成一片。珍妮的前男友蔡斯羞辱了约什，他也意识到自己和珍妮之间存在着价值观的巨大差别。在一系列啼笑皆非的事件过后，约什决定面对自己内心真实的选择，放弃法学院，一边继续做服务员一边完成自己的作家梦。在经理高飞的带领下，餐厅员工集体辞职，在隔壁开了一家属于他们自己的新餐厅。为报复便利店东主Leo非礼的恶行，女店员秀娜及嘉欣与男友正曦及小肥想到打劫便利店实行大整蛊。　　啤酒妹Ling与沉迷赌波的男友柏豪因金钱问题濒临分手，柏豪为阻止Ling出卖肉体代还赌债，决定挺而走险打劫便利店，Ling苦苦跟随试图阻止……　　阿融借用新男友William向女同志Wylie提出分手，Wylie怀恨在心。原来阿融的新欢另有其人，正是另一个女同志Carolyn，二人早计划利用William作档箭牌令旧爱死心！　　探员James在酒吧拘捕外围艇仔Gary后，根据其线报前往外围窦口拉人，在抵达目标单位附近，发现那里竟发生杀人事件、行劫和交通意外！　　便利店遭戴着面具的男人打劫，一名顾客背脊中刀受伤倒地，歹徒事见事败夺门而去，负责把风的女子跑出马路接应，被私家车撞倒，倒卧在血泊中。　　私家车内的二名青年计划打劫便利店，可惜在偷车过程中出了岔子，拖延了行动时间！二人赶着前往时竟撞死一名冲出马路的女子，即时吓得张口舌结。一夜之间的连串意外，看似是偶然，但实质皆因他们……七个高中朋友相约来到一个古堡里，他们把灵魂出卖给了500年前的魔鬼，然后他们陷入了一场血腥的厮杀...1958年初春，新疆维吾尔自治区掀起大跃进的高潮。绿洲农业生产合作社副主任帕塔木汗，从内地学习回来。她积极响应上级关于粮食自给的号召，主张到沙园子开荒种粮。但社主任哈斯木认为绿洲社一向是以经济作物为主，粮食的来源主要靠买政府的商品粮，今后仍然要坚持这样的原则。他在投机商人木沙牙行的怂恿下，一心要搞副业赚钱。帕塔木汗并不反对发展副业，但她认为增产粮食是根本。她不顾哈斯木的反对，依靠贫下中农，组织社员去开荒，并得到沙园子农业合作社主任哈力克和社员们的热情帮助，种上了小麦。不料就在麦苗茁壮成长的时候，刮起了八级大风，飞沙淹没了麦田，也摧残了不少果树。帕塔木汗马上组织群众抢救，而哈斯木则认为麦子已无法挽救，不如放弃算了。在大家忙着抗灾的时刻，木沙牙行和地主吐然伯克却在一边幸灾乐祸，并煽动哈斯木把一部分副业队的人拉出去打短工，并且要把社里的棉、菜种籽带到自由市场高价出售。帕塔木汗及时发现了问题，劝告哈斯木不能听木沙牙行这些人的话。可是哈斯木误会帕塔木汗是为抬高自己，故意与他作难。后来，帕塔木汗在哈力克的帮助下，救活了麦苗，获得了丰收。之后，哈力克的爷爷赛义提找帕塔木汗的父亲热依木去说亲，木沙牙行从中造谣破坏。哈斯木也不问青红皂白跑到两社联合开荒的工地上，与帕塔木汗和哈力克大吵大闹，说他们在并社问题上公私不分。哈山乡长和张书记看出这不仅是哈斯木的思想问题，背后一定有坏人煽动，他指示帕塔木汗要调查研究。帕塔木汗依靠群众的力量，很快就掌握了木沙牙行和吐然伯克造谣破坏和盗窃集体财物的罪证。在事实面前，木沙牙行和吐然伯克不得不低头认罪。哈斯木在党组织的帮助下，如梦初醒，悔恨被敌人蒙骗、利用。最后，绿洲、沙园子等农业合作社合并成立了人民公社，坎儿井、渠道也修成了，清清的泉水流向新开垦的田地，千年黄沙变绿洲。