《小门神》的故事发生在当代的人间江南小镇和神界。门神神荼和郁垒是两兄弟。因为近年人间不再关注神仙，神界经济萧条，门神、土地爷、八仙等等小神们面临下岗失业的危险。门神郁垒决定去人间，做一番惊天动地的事情，证明门神的价值。郁垒和神荼先后来到人间，遇到了小镇上的单亲母女小英和雨儿，之后发生了一系列意想不到的有趣惊险故事。杰克帮助亲戚照料农场，有一个不道德的兽医正在打他的主意，希望他能和臭名昭著的西弗兰德斯人进行暗箱里的牛肉交易。他不仅把非法购买来的荷尔蒙用在牛身上，而且还用在自己身上。这种看似平静的暗地交易没有持续多久，就被警方的抓捕行动打破了。随之浮出水面的是杰克那难以理清、复杂而又令人震惊的过去。警方的到来就像是捅了马蜂窝一样，引起了众多人物的一连串的连锁反应。最终，这些事件将所有人的命运引入了不可预知的黑洞。仿佛比利时静谧的村庄后都隐藏这令人难以捉摸的真相。距离东京三百公里外的凤凰岛上，发生了一起人员被马匹踩踏而死的事件，谁知却让杉下右京（水谷丰饰）的老搭档神户尊（及川光博饰）找上门来。原来这座私人小岛正提供给有自卫队背景的某民兵组织作为训练基地，而该组织似乎涉嫌制造生化武器。神户受警察厅次长甲斐峰秋（石坂浩二饰）指派，命令杉下与搭档甲斐享（成宫宽贵饰）以调查命案的名义前往凤凰岛，暗中侦查生化武器的证据。特命系二人组在民兵组织负责人神室司（伊原刚志饰）的引导下来到事故现场，而杉下则察觉到这起意外背后似乎有着某种人为的因素存在。当他和随后赶来的伊丹（川原和久饰）等人渐渐逼近事实真&相时，心怀鬼胎的政要突然命令自卫队对他们采取行动……在一次毁灭性的地面入侵之后，一小群城镇居民不得不联合起来。在他们挣扎求生的过程中，他们意识到必须比袭击者领先一步，共同努力争取反击的机会……追寻着杂志上报道的月虹，日本男孩玲雄和女友来到夏威夷岛旅行，邂逅了岛北端霍诺卡坷村镇上的老式影院。半年后，从大学休学的玲雄独自回到镇上，在影院担任放映助理。他逐渐融入当地简单安详的生活，并和擅长料理又爱恶作剧的比婆婆成为了朋友。比婆婆邀请玲雄每天到她家享用美食，两人结伴到山谷中等待月虹。一天玲雄结识了活泼爱笑的姑娘玛莱亚，后者很快成为他生活中的阳光。被冷落的比婆婆闷闷不乐，玲雄却浑然不觉。生日当晚玲雄带玛莱亚到比婆婆家吃饭，玛莱亚因比婆婆的料理过敏入院。玲雄打电话质问比婆婆，却得知她突然失明的消息。同时玲雄工作的影院正面临停业。在夏威夷轻柔吹拂的海风中，男孩悄然经历着成长的抉择。一个寂寞的男人无意间拿到了一份万圣节派对的请柬，他欣喜赴约，结果穿越布鲁克林区，到达最终目的地后，他才发现原来自己被一伙流氓算计了，后者正想为了所谓的“艺术”，拿他开刀呢。