诺亚和卡特丽娜回到了多巴哥岛的天堂，三年前他们坠入了爱河。然而，当诺亚的求婚被拒绝时，天堂很快就变成了令人心碎的监狱。陈飞和尊尼都是来自单亲家庭的年青警员，处事也都不成熟，加上性格迥然不同，相处中产生许多矛盾。偏偏陈飞的父亲和尊尼的母亲相恋，使两人关系更形紧张，闹出许多笑话。后来，两人通过侦查罪案增进了解、冰释前嫌。摩洛哥留学生Yassine拿着学生签在巴黎学习建筑师专业。偶然发生的不幸事件，让他挂了科，丢了护照，成了在法国的外国三无人士。为了能继续留在法国，他选择和他最好的朋友结婚。当他觉得这事儿终于搞定了的时候，一位婚姻调查员悄悄来到他们身边……二战期间的中途岛战役中，由于日本的袭击，盟军对于作战前线的补给越来越少，但这并未能阻止美军在太平洋战场上的取胜，同时美国正努力弥补珍珠港事件的巨大损伤，并在以后的故事中逐渐击败了法西斯日本。经过与一十一（神木隆之介饰）的恶战，濑文焚流（加濑亮饰）身受重伤，命几不保。在此期间，青池里子（栗山千明饰）随女儿小润（森山树饰）悄然离开医院；而各国政要的一次关于简单计划的秘密会议上，自称卑弥呼的日本代表抹杀所有人，他代表SPEC持有者正式向普通人类宣战。世态险恶的当下，濑文急急出院，和当麻纱绫（户田惠梨香饰）一同调查青池母女的行踪。而野野村组长（龙雷太饰）则独自行动，查找简单计划病毒疫苗的下落。新的SPEC持有者交替登场，残酷的杀戮却从未停止。关于前人类的秘密昭然若揭，惨烈浩大的人种战争即将拉开序幕……本片为SPEC系列完结篇的前篇。安琪、程晖、周健共事一间警署，且安琪与程晖是公认的一对。一次行动中，健舍身救安琪，令安琪感动，明白健对她的感情。晖大方退出。但对健怀恨在心。一次行动中，健不幸牺牲，安琪受打击，晖乘机而入，琪再投入他的怀抱。