水族箱里诞生了4条小鱼，其中包括哈罗德的女儿伊莎贝尔。伊莎贝尔的身上长着不好看的斑点还缺失了一些鳞片，她的长相遭到鱼群的其他成员嘲笑。鱼群首领瑟斯顿要求哈罗德必须把伊莎贝尔藏起来否则被人来发现将会把他们丢进大海里。贪玩的伊莎贝尔还是被人类发现了，她和哈罗德一起被丢进浩瀚无边的大海里。海上突如其来的巨大风浪使得水族箱里的鱼都掉进大海,一时之间，伊莎贝尔和哈罗德失散了。伊莎贝尔偶遇了艾普尔并结识了一群长相奇特的鱼，它们皆因外在缺陷被同族排挤。在艾普尔的带领下，伊莎贝尔和其它鱼准备穿越火山抵达珊瑚礁寻找哈罗德。另一边，哈罗德在海黄瓜卡尔的陪同下找寻女儿未果，伤心欲绝，随鱼群离去。成功穿越火山的伊莎贝尔在珊瑚礁与哈罗德相遇，而珊瑚礁女王的出现更令父女惊喜，原来女王竟是伊莎贝尔的妈妈。一家人欢聚在一起。一条生活在海洋里的马鲛鱼被渔网捕捉，而后被困在了一家海鲜餐馆的水箱里。从那以后她不屈不挠地寻找逃脱的方法。跟水箱里其他来自渔场的鱼不同，悲观的怀疑论者“老比目鱼”也生长在大海。作为水箱里幸存时间最长的一条鱼，他凭借其生存之道控制着其他的鱼。对他而言，马鲛鱼试图逃出水箱的举动已经对他的统治构成了威胁。作家巴里（约翰尼·德普JohnnyDepp饰）正处于灵感枯竭期。他每天经过公园的时候，都会看见里面有一帮小孩在嬉戏。他停下脚步来观察，原来孩子在玩海盗游戏，孩子们还热情邀请他加入海盗队伍。巴里成了一个大孩子，在队伍中虽然高出一个头，却玩得不亦乐乎——道具、角色、各色情节、公园变成一个快乐的幻想世界。这段经历，成了巴里创作《小飞侠》的灵感源泉。　　孩子的母亲（凯特·温丝莱特KateWinslet饰）是一个寡妇，她也受到了这里快乐的气氛感染。巴里和他们相处就像一家人一样，享受着单纯的快乐，然而也难免招人闲话。而巴里的妻子，也终究只属于现实世界，走不尽巴里的内心。　　《小飞侠》的完稿上演，遭到了众人的质疑。然而演出后当地的反响，证明了巴里的坚持是正确的。但这时，巴里和孩子们正面临着一场来自现实世界的巨大打击，他们善良的母亲，正在离他们远去……霍维和贝卡原本过着悠哉快活的中产阶级生活，夫妻恩爱，儿子丹尼乖巧伶俐，但是一场车祸夺去丹尼的性命，也彻底摧毁霍维夫妇的生活。贝卡从此将自己禁锢在家中，虽然试图通过各种方法消解心中的悲痛，然而她久久无法将儿子的身影从记忆中抹去；霍维试图装作一切从未发生，结果反与妻子的关系日益紧张，争吵不断。贝卡偶然遇见那个导致儿子死亡的高中男孩，她开始有意识地去接近他。烦躁孤独的霍维，则似乎正寻找一个心灵的港湾……在一个星空璀璨的空间里，有一只名叫茉莉的小怪物，她有一个好朋友，名叫艾迪森，是一个发条玩具，他很喜欢跟茉莉一起玩，所以当茉莉将所有的精力转移到别的什么上面的时候，他开始表现出强烈的不满。小茉莉正在织一个红色的帽子，打算送给自己未出世的弟弟，很快，茉莉的弟弟被生出来了，但是那仅仅是一个魔蛋，那个蛋需要去蛋岛孵化才能顺利生出小怪物，于是一家人开始准备着出发启程去魔岛。但是在出发之前，茉莉在去给爸爸送帽子的时候，因为走得仓促，帽子被忘在了家里，而直到上车的最后一刻，茉莉才被告知，她太小是不被允许去蛋岛的，茉莉跟艾迪森本来在和叔叔们玩棒球，但茉莉忽然发现了帽子并没有被爸爸带走，而是被留在了家里。于是，为了追上爸爸和妈妈的车，茉莉赶上了循环火车，希望能在爸爸妈妈离开之前拦住他们，将帽子让他们带走。他们来到了绵延山脉区，但茉莉还是没来得及追上爸爸妈妈的车，她最后决定，带着艾迪森一起前往蛋岛，给未出世的弟弟送帽子。与此同时，小怪物茉莉的叔叔们收到了茉莉寄回去的信，上面解释了小怪物茉莉忽然消失的原因，她要去给未出世的小弟弟送帽子，而艾迪森全程跟着小怪物茉莉一起去了。于是叔叔们也开始驾着车去寻找小怪物茉莉，而小怪物茉莉的爸爸妈妈知道茉莉出门找他们之后，也开始对她和艾迪森进行寻找，终于，他们所有人同小怪物茉莉会和，并且带着茉莉一起前往蛋岛。塞巴斯蒂安（BaptisteLecaplain饰）生命中只有一个野心：什么也不做。他的世界，就是他的沙发。他并不想维持生活，只想发呆。但今天，如果你什么也不做，那你什么也不是。两个室友则不断地做实习打零工，塞巴斯蒂安不得不做一点事。